Le directeur assure la gestion administrative et exécute les décisions du Conseil d'administration. Les plaintes que l'Autorité reçoit de l'extérieur (individuelles ou institutionnelles - régulateurs étrangers, administrations luxembourgeoises) sont vérifiées quant à leur recevabilité par le Conseil d'administration ; ce n'est qu'ensuite que le directeur procède à une instruction.

Le directeur assiste en principe aussi bien aux séances du Conseil d'administration qu'à celles de l'Assemblée consultative de l'ALIA et ce avec voix consultative.

La direction de l'ALIA est assurée à partir de juin 2014 pour une période de cinq ans par Romain Kohn. Il est assisté dans ses fonctions par Carole Fonck et Carole Kickert.